1楼：中药饮片库、中成药库、煎药室、智能中药药房、MR室（磁共振室）

2楼：后勤管理科、迁建办、采购办、档案室、院感办、设备科、信息科2室

3楼：药学部、医用耗材室、西药库、药品会计

4楼：副院长室、医务科、护理部、医保办、物价办

5楼：院长室、书记室、副院长室、办公室、工会、创文办、文印室、湛江市中医药学会

6楼：会议室、党委办、人事科、信息科1室、科教科、绩效核算管理办、纪检监察科、质控办